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Cegma

mardi 23 juin 2015 (11 years ago) cegma Book

  • Langue: Français
  • Nombre de page: 1
  • Taille du fichier: 36.22 KB
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Jor_ElB La página del cegma está caída. Se arruinaron mis planes para el finde.
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kbradnam One week left in Davis and I am still getting CEGMA support emails!
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NishiyamT NCBIでplatypus genome探したら、scaffold N50 991,605に見えるファイルが見つかったけど、genomeでCEGMA complete 34%, transcriptの方では63%... sequence が6Xしかないのが厳しかったんでは。
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NishiyamT .@mkasahara 1.8Gbのゲノムだから。大きいゲノムはたいてい個々の遺伝子(イントロン)も大きい。scaff がMbに乗ってもまだ難しい。イントロン認識もきびしいので、アノテーション使った方がCEGMA高くなるのも。
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umishida_sci @mkasahara ヤツメはCEGMAかけるとそうとう低いときいた気がします。古い魚のCEGMA値一覧をみてびっくりしたことが。解析されたのが昔だからかと思いましたがゲノム自体もむずかしいんですね。

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